INVENTRO.

Dane eksperymentalne dla
badań przedklinicznych.

Nasze modele AI wskazują hipotezy warte przetestowania. Laboratorium przeprowadza eksperymenty. Łączymy oba podejścia, aby wspierać decyzje w przedklinicznym rozwoju leków onkologicznych: co kontynuować, co zbadać ponownie, a z czego zrezygnować.

01 / OD AI DO EKSPERYMENTU

Więcej hipotez. Ograniczone możliwości ich przetestowania.

AI może wskazać więcej hipotez dotyczących działania związków, niż zespół jest w stanie przetestować. Kluczowe staje się wybranie tych, które warto zbadać, i ustalenie, czy przewidywania znajdują potwierdzenie w modelu biologicznym.

BADANIA / ZAKRES

Zaczynamy od Twojego pytania.

Szukamy związków dla wybranego celu lub celów dla danego związku. Sprawdzamy możliwe połączenia związków. Badamy odpowiedź różnych modeli nowotworów lub pojedynczych próbek na badane związki. Pierwszy etap prac dopasowujemy do Twojego pytania i dostępnych danych.

Możesz zacząć od analizy obliczeniowej, badania laboratoryjnego bez części obliczeniowej lub projektu łączącego oba podejścia. Zakres wynika z pytania.

AI / PRZEWIDYWANIE

Wybieramy, co zbadać.

Rozwijamy własne modele AI przewidujące cele molekularne i aktywność biologiczną związków. Na tej podstawie wybieramy kandydatów do eksperymentów. W razie potrzeby korzystamy też z zewnętrznych narzędzi obliczeniowych.

Same przewidywania nie pozwalają ustalić, jak związek zachowa się w komórkach, jaka będzie jego toksyczność ani czy okaże się skuteczny klinicznie.

LABORATORIUM / EKSPERYMENT

Sprawdzamy hipotezę.

Projektujemy eksperymenty mierzące aktywność związków i odpowiedź komórek. Metody oraz kontrole dobieramy do pytania badawczego.

Wyniki odnoszą się do badanego modelu i warunków eksperymentu. Wynik in vitro nie potwierdza skuteczności u pacjentów. Badania ex vivo na materiale od pacjentów są w fazie rozwoju.

NAUKOWCY / INTERPRETACJA

Wskazujemy kolejny krok.

Porównujemy przewidywania z obserwacjami, oceniamy niepewność i rekomendujemy, co kontynuować, co zbadać ponownie, a z czego zrezygnować.

Rekomendacja wynika z oceny naukowej, a nie z automatycznego werdyktu AI. Decyzja badawcza pozostaje po stronie Twojego zespołu.

Typowy schemat działania. Obrazy mikroskopowe z archiwum Inventro.

Ten sam zespół opracowuje przewidywania i weryfikuje je eksperymentalnie.

Dzięki temu widzimy, kiedy modele się sprawdzają, a kiedy zawodzą. Możemy lepiej sformułować kolejną hipotezę lub zaplanować eksperyment. Na tym polega wartość połączenia AI i biologii eksperymentalnej w pracy nad jednym pytaniem badawczym.

02 / CO ROBIMY

Cel molekularny. Związek. Pytanie do rozstrzygnięcia.

Dostarczamy dane biologiczne zespołom biotechnologicznym, twórcom modeli AI i firmom zajmującym się odkrywaniem i rozwojem leków. Współpracę można rozpocząć od analizy obliczeniowej, badania laboratoryjnego lub projektu łączącego oba podejścia.

WYBÓR ZWIĄZKÓW DO BADAŃ

Które związki działają na mój cel?

Wykorzystujemy własne modele AI do stworzenia rankingu związków dla określonego celu białkowego i zaplanowania ukierunkowanych badań.

Co otrzymaszLista wybranych związków, uzasadnienie wyboru i plan weryfikacji eksperymentalnej.

POSZUKIWANIE CELÓW MOLEKULARNYCH

Na jaki cel działa mój związek?

Badamy potencjalne cele białkowe, łącząc przewidywania modeli Inventro, dane o aktywności i literaturę naukową.

Co otrzymaszRanking hipotez dotyczących celów, opis ograniczeń i propozycja eksperymentów.

BADANIA DZIAŁANIA SYNERGISTYCZNEGO

Z czym mój związek może działać synergistycznie?

Szukamy związków, które mogą działać synergistycznie z Twoim, i projektujemy eksperymenty oceniające efekt ich łącznego działania.

Co otrzymaszPropozycje połączeń związków i plan ich sprawdzenia.

ODPOWIEDŹ NOWOTWORÓW

Które typy nowotworów mogą odpowiedzieć?

Na podstawie dostępnych danych i odpowiednich modeli przedklinicznych badamy, w jakich typach nowotworów związek może wykazywać aktywność.

Co otrzymaszHipotezy dotyczące odpowiedzi oraz dobór modeli do dalszych badań.

ODPOWIEDŹ KONKRETNEJ PRÓBKI

Które leki działają w tej próbce?

W ramach rozwijanego programu ex vivo badamy odpowiedź materiału od pacjentów na związki.

Co otrzymaszPropozycja badań dla danego typu próbek. Zakres badania ustalamy po ocenie dostępnego materiału i przydatności modelu.

Te pytania wyznaczają kierunek naszych badań. Wykonalność i zakres ustalamy dla każdego projektu. Wyniki służą badaniom przedklinicznym i nie są podstawą decyzji terapeutycznych.

Jak pracujemy

03 / JAK PRACUJEMY

Jedno pytanie. Dane potrzebne do podjęcia decyzji.

Przewidywania modeli i pomiary laboratoryjne służą odpowiedzi na to samo pytanie. Wspólnie ustalamy zakres: od listy wybranych kandydatów po wyniki eksperymentów potrzebne do decyzji na etapie przedklinicznym.

AI / METODY OBLICZENIOWE

Przewidujemy cele molekularne. Wybieramy związki do badań.

Punktem wyjścia jest cel białkowy lub związek. Nasze modele AI przewidują oddziaływania z celami i aktywność biologiczną, wskazując hipotezy warte sprawdzenia.

Własne modele, uzupełnione wybranymi narzędziami zewnętrznymi.

Łączymy nasze przewidywania z literaturą i bazami danych. W razie potrzeby sięgamy po zewnętrzne narzędzia do przewidywania struktury lub powinowactwa. Oceniamy dostępne przesłanki i wybieramy hipotezy do badań.

  1. Związki do analizy

  2. Modele i dane

  3. Ranking hipotez

Odsetek aktywnych związków

Związki z publicznej biblioteki
29,6%8 z 27 związków wykazało aktywność
Nowe związki
9,1%6 z 66 związków wykazało aktywność

Związki wybrane przy użyciu AI i sprawdzone w dwóch badaniach biochemicznych CLK1. Odsetki dotyczą tych konkretnych badań, a nie ogólnej trafności modelu.

Ocena na danych nieznanych modelowi

Sprawdzamy przewidywania na danych o oddziaływaniach lek–cel opublikowanych po okresie, z którego pochodzą dane użyte do uczenia modelu. Korzystamy również z eksperymentalnych danych referencyjnych.

W projekcie obliczeniowym otrzymujesz ranking kandydatów i plan ich weryfikacji.

Zobacz demo platformy AI

BIOLOGIA / METODY EKSPERYMENTALNE

Mierzymy aktywność. Badamy odpowiedź komórek.

Sprawdzamy wybrane hipotezy w testach biochemicznych, modelach komórkowych i obrazowaniu ilościowym. Pomiary i kontrole dobieramy do pytania badawczego.

Badania biochemiczne i komórkowe

Mierzymy aktywność związków, żywotność komórek, cytotoksyczność i apoptozę. Pomiary funkcjonalne pozwalają dokładniej scharakteryzować odpowiedź.

Obrazowanie wieloparametrowe i mikroskopia żywych komórek

Analizujemy pojedyncze komórki, rozróżniamy populacje i śledzimy zmiany proliferacji, lokalizacji białek oraz odpowiedzi w czasie.

Badania ex vivo na materiale od pacjentów

Łączny wynik pomiaru żywotności może ukrywać różnice między populacjami komórek. Rozwijamy badania na materiale nowotworowym od pacjentów, aby osobno oceniać odpowiedź komórek nowotworowych i komórek ich otoczenia na ten sam związek.

  1. Pozyskanie materiału od pacjenta

  2. Autorskie protokoły eksperymentalne

  3. Sekwencyjne obrazowanie mikroskopowe

Wiele cech komórek, mierzonych z zachowaniem ich kontekstu biologicznego.

Obrazy z własnych badań mikroskopowych Inventro.

Wspólny obraz komórek z markerem A i markerem B; jądra wybarwiono na niebiesko.
Osobny obraz populacji z markerem A: komórki wybarwione na zielono oraz jądra komórkowe.
Osobny obraz populacji z markerem B: komórki wybarwione na czerwono oraz jądra komórkowe.

Rozróżniamy populacje, aby osobno zmierzyć ich odpowiedź.

Odrębny przykład badania w kokulturze. A+ i B+ oznaczają populacje dodatnie dla odpowiednich markerów, a nie typy komórek na obrazach ex vivo.

Zobacz oryginalną rycinę
Związek A
Odpowiedź na związek A: znormalizowana liczba wszystkich komórek oraz populacji X i Y przy rosnących stężeniach związku na skali logarytmicznej.
Związek B
Odpowiedź na związek B: liczba komórek populacji Y spada szybciej niż populacji X wraz ze wzrostem stężenia; krzywa dla wszystkich komórek przebiega pomiędzy nimi.

Różne populacje komórek. Różne odpowiedzi na związek.

Dane eksperymentalne: znormalizowana liczba komórek. Odrębne badanie od przykładu A+/B+. Na oryginalnych wykresach zachowano angielskie oznaczenia.

Zobacz oryginalną rycinę

Co otrzymasz

Translational Evidence Package (TEP)

Wyniki eksperymentów z interpretacją wspierającą kolejną decyzję badawczą.

Analiza wyłącznie obliczeniowa ma odrębny zakres wyników.

Odpowiedź na pytanie

Rekomendacja, co kontynuować, co zbadać ponownie, a z czego zrezygnować, uzasadniona zebranymi wynikami.

Wiarygodność i ograniczenia

Raport z interpretacją: na ile wyniki pozwalają wyciągać wnioski i co pozostaje nierozstrzygnięte.

Kolejny eksperyment

Propozycja dalszego badania, które pomoże zmniejszyć niepewność istotną dla Twojej decyzji.

Wyniki gotowe do dalszej pracy.

Dane uzyskane w badaniu, np. zależności odpowiedzi od stężenia lub analizy odpowiedzi poszczególnych populacji komórek, wraz z dokumentacją metod, kontroli i interpretacją naukową. Zawartość pakietu uzgadniamy przed rozpoczęciem prac.

04 / ZESPÓŁ

Łączymy doświadczenie naukowe i biznesowe.

Nasz zespół ma doświadczenie w medycynie, biologii systemów, modelowaniu molekularnym i badaniach eksperymentalnych.

Tomasz Nowowiejski

Prezes zarządu (CEO)

Lekarz i absolwent MBA z doświadczeniem w ochronie zdrowia, technologiach medycznych i przedsięwzięciach biotechnologicznych.

Profil LinkedIn

Michał Komorowski

Dyrektor naukowy (CSO)

Biolog systemów, który zdobył doświadczenie w Warszawie, Warwick i Imperial College London. Stworzył laboratorium Inventro.

Profil LinkedIn

Piotr Setny

Kierownik zespołu AI

Lekarz, doktor habilitowany nauk fizycznych (Uniwersytet Warszawski). Specjalizuje się w komputerowym projektowaniu leków i modelowaniu molekularnym.

Jarosław Walczak

Kierownik zespołu biologii

Doktor nauk biologicznych (Instytut Nenckiego PAN). Projektuje i prowadzi badania in vitro w modelach komórkowych.

Profil LinkedIn

Paweł Burzyński

Finanse i rozwój biznesu

Przedsiębiorca i doradca strategiczny z ponad 20-letnim doświadczeniem w finansach i technologiach.

POROZMAWIAJMY O BADANIACH

Jakie pytanie chcesz rozstrzygnąć?

Zanim przejdziesz do kolejnego etapu rozwoju, ustal, co warto sprawdzić eksperymentalnie. Opowiedz nam o celu molekularnym, związku lub pytaniu badawczym.

contact@inventro.co